Δύο χρόνια μετά την απόσυρση του από την ενεργό δράση, ο Φραν Γέστε αποφάσισε να επιστρέψει στο ποδόσφαιρο από άλλο, όμως, πόστο.
Ο Βάσκος ξεκίνησε καριέρα ως προπονητής.
Τα πρώτα του βήματα θα τα κάνει στην ομάδα Νέων της ομάδας από την χώρα των Βάσκων, Ιτζουμπαλτζέτα.
Ο τελευταίος σταθμός στην ποδοσφαιρική καριέρα του 35χρονου ήταν η Μπανίγιας, ωστόσο, το μεγάλο όνομα το δημιούργησε κατά την παρουσία του στην Αθλέτικ Μπιλμπάο, ενώ πέρασε και δεν… ακούμπησε από τον Ολυμπιακό.
